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質粒DNA分離方法比較

更新時間:2017-07-26點擊次數:2579

 

發(fā)酵後(hòu)的E.Coli培養液

用低速大容量冷凍(dòng)離心機(jī),大容量甩平或角式轉頭(3000~6000rpm,30~15min)或高速連續流轉頭(10000~18000rpm,流量300~600ml/min)

E.Coli菌體沉澱

用溶菌酶破細胞壁

用表面活性劑(jì)破細(xì)胞膜(如Triton X-100,SDS等)

大部分染色體DNA粘附在膜蛋白上,用一定濃度的鹽溶液(如1 mol NaCl 或1 mol 醋酸鈉)溶解後台式高速離心機(Eppendorf管10000rpm,10min)或高速冷凍(dòng)離心機10000~12000rpm×10min,上清中大部分爲染色體DNA,沉澱(diàn)中含質粒DNA,降解的質粒DNA,RNA及蛋白質

 

在沉澱(diàn)中加入異(yì)丙醇得到粗制的質粒DNA

 

沉澱(diàn)中加入TE緩沖(chōng)液(pH8.0)

 

粗制DNA在-20℃在重力狀态喜愛(ài)沉澱(diàn)15min以上,高速離心機12000rpm(近15000g)4℃離心5min去上清

 

用苯酚抽提去蛋白質(zhì)或用分子篩(shāi)去蛋白質(zhì)

 

用RNA酶降解RNA

真空中抽去異丙醇,溶液中加入TE緩(huǎn)沖(chōng)液

 

 

過(guò)柱(聚丙烯酰胺)RNA留柱,質(zhì)粒DNA過(guò)柱

加入E.B及Triton X-100,在CsCl中(預制梯度或平衡等密度離(lí)心,自形成梯度)用角轉頭,近垂直轉頭做超速離(lí)心(見(jiàn)文獻10)

 

 

較(jiào)純(chún)的質粒DNA,但含有5~10%的染色體DNA和降解的DNA片段

剩餘的蛋白質上浮 ,RNA沉澱,染色體DNA在離心管中上部形成區帶(dài),質粒DNA在離心管中下部形成純(chún)樣品區帶(dài)

 

 

 

 

密度梯度儀或其他簡易方法從(cóng)離心管中抽出,經過帶(dài)流動池的分光光度計後分部收集 ,從(cóng)吸光度峰可以判斷質粒DNA所在的位置

 

 

 

 

去CsCl,去其他組分得到高純(chún)度質(zhì)粒DNA

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